如何用perl处理？
时间：2011-01-29
来源：互联网
有一组数据，例如下：
ACACA matches ACACA
ACAS2L previous symbol of ACSS1
AD-020 alias of TMEM167B
ADCY3 matches ADCY3
ADCY3 previous symbol of ADCY8
AIP alias of AURKAIP1
AIP matches AK2
在第一列如果有重复，则选择行里含有matches的项，而删除不含matches的项，如ADCY3有重复，则保留ADCY3 matches ADCY3；AIP有重复，则保留AIP matches AK2
行，上例的最终处理结果应该为：
ACACA matches ACACA
ACAS2L previous symbol of ACSS1
AD-020 alias of TMEM167B
ADCY3 matches ADCY3
AIP matches AK2
请教这一程序如何编写？
附件为data。谢谢！
ACACA matches ACACA
ACAS2L previous symbol of ACSS1
AD-020 alias of TMEM167B
ADCY3 matches ADCY3
ADCY3 previous symbol of ADCY8
AIP alias of AURKAIP1
AIP matches AK2
在第一列如果有重复，则选择行里含有matches的项，而删除不含matches的项，如ADCY3有重复，则保留ADCY3 matches ADCY3；AIP有重复，则保留AIP matches AK2
行，上例的最终处理结果应该为：
ACACA matches ACACA
ACAS2L previous symbol of ACSS1
AD-020 alias of TMEM167B
ADCY3 matches ADCY3
AIP matches AK2
请教这一程序如何编写？
附件为data。谢谢！
data.zip (14.74 KB)
作者: bioinfor 发布时间: 2011-01-29
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复制代码
- #!/usr/bin/perl
- use strict;
- use warnings;
- use Data::Dumper;
- my %hash;
- open(IN,"$ARGV[0] " )||die "can't open $ARGV[0]";
- while (<IN>) {
- chomp;
- my @list=split (/\s+/,$_,2);
- if (!exists $hash{$list[0]}) {
- $hash{$list[0]}=$_;
- }elsif($list[1]=~/matches/){
- $hash{$list[0]}=$_;
- }
- }
- close IN;
-
- print Dumper %hash;
-
- __DATA__
- ACACA matches ACACA
- ACAS2L previous symbol of ACSS1
- AD-020 alias of TMEM167B
- ADCY3 matches ADCY3
- ADCY3 previous symbol of ADCY8
- AIP alias of AURKAIP1
- AIP matches AK2
作者: bernana 发布时间: 2011-01-30
运行有错误啊
作者: bioinfor 发布时间: 2011-01-30
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