这两种方案我该选哪种？

自从tommyframework发布以来，得到了广大PHPER的喜爱。
有好多支持者给我发来email.说框架不错，很喜欢。只是框架项目的目录结构
需要改善一下则更加完美了。
借鉴了国外优秀的PHP框架。
目前对于tommyframework新版本项目的目录结构
制订了两种方案。
各位童鞋，麻烦帮我看下，哪种方案更加合理。先谢！

方案一：
index.php
controllers
models
views
widgets
extensions
config
cache
logs
assets
themes
images
doitphp
tools

方案二：
index.php
application
   cache
   config
   controllers
   models
   views
   widgets
   extensions
   logs
assets
images
themes
doitphp
tools

（注：方案二中是将cache, ...logs等目录放在根目录中的application目录中。本人比较看中第二种方案，与yii相比只差一个css目录）

我认为选择第二种最好啦  


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第二种  选择第二种   

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目录中的tools最后是要删除的。因为这是辅助开发工具。当项目完工时，这个目录就可以删除了。
如果整个项目没有用到theme。那么最后themes目录也将可以删除。
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不过用惯CI的朋友建议将images目录应放在assets内。

经过多方征集。
现在制订第三种方案
方案三：
index.php
application
   cache
   config
   controllers
   models
   views
   widgets
   extensions
   logs
assets   
   images
themes(如果项目用不到可删除)
doitphp
_tools（辅助开发工具,项目完成后将删除）