如何对linux下的大型工程进行项目管理？

举例来说：一个工程对应一个主程序，另外多个动态链接库so文件。当然这个so的数目多少视项目大小了。

我的想法：
1、 每个so动态链接库对应一个自己的文件夹，各自独立的编译出自己的so文件。
2、 主工程单独的项目目录，链接系统so库以及自己的so动态库，进行编译。

我应该如何针对这种相对涉及子项目工程较多的项目进行编译管理和版本管理？
在主工程目录建立一个makefile文件管理所有的子工程（so文件工程）？还是
每个工程独立的makefile自己管理，主工程最后编译自己的makefile链接其他
自己的so文件以及系统lib文件？

请指点。谢谢。

可以一个总得makefile，调用其他子makefile。