perl数组比较求助
时间:2011-07-06
来源:互联网
各位XDJM:
小弟在工作上遇到一个困难,请求各位大大帮助一下。谢谢。。。文件格式如下:
SNP_A-4194556 AB 0.016 BB 0.026 AB 0.036 AA 0.115 rs12058711
SNP_A-4200262 BB 0.045 BB 0.109 BB 0.093 BB 0.243 rs11205411
SNP_A-2244055 BB 0.049 AB 0.012 BB 0.023 BB 0.049 rs11205401
SNP_A-2105213 AB 0.006 AB 0.092 AA 0.001 AB 0.037 rs12748771
文本就是这种格式,主要有4列的,形式如同AA,AB,AB,AA这样的数组,在每行进行比较,如果在某行中,前3个数组的元素相同,而与第4个数组的元素不同,则把这一行的全部内容输入到另一个文本中去。。
用perl编写一下。谢谢啦。
小弟初学PERL,感觉这个思路是这样,但是无法实施到代码上。希望能在各位的帮助下学习一下。。。谢谢
小弟在工作上遇到一个困难,请求各位大大帮助一下。谢谢。。。文件格式如下:
SNP_A-4194556 AB 0.016 BB 0.026 AB 0.036 AA 0.115 rs12058711
SNP_A-4200262 BB 0.045 BB 0.109 BB 0.093 BB 0.243 rs11205411
SNP_A-2244055 BB 0.049 AB 0.012 BB 0.023 BB 0.049 rs11205401
SNP_A-2105213 AB 0.006 AB 0.092 AA 0.001 AB 0.037 rs12748771
文本就是这种格式,主要有4列的,形式如同AA,AB,AB,AA这样的数组,在每行进行比较,如果在某行中,前3个数组的元素相同,而与第4个数组的元素不同,则把这一行的全部内容输入到另一个文本中去。。
用perl编写一下。谢谢啦。
小弟初学PERL,感觉这个思路是这样,但是无法实施到代码上。希望能在各位的帮助下学习一下。。。谢谢
作者: 努力学习PERL 发布时间: 2011-07-06
回复 努力学习PERL
没明白,你指的数组相同是啥?
以
SNP_A-4194556 AB 0.016 BB 0.026 AB 0.036 AA 0.115 rs12058711
为例, 你指的是"AB",还是"AB 0.016",还是"0.016"?
没明白,你指的数组相同是啥?
以
SNP_A-4194556 AB 0.016 BB 0.026 AB 0.036 AA 0.115 rs12058711
为例, 你指的是"AB",还是"AB 0.016",还是"0.016"?
作者: yinyuemi 发布时间: 2011-07-06
QUOTE:
回复 努力学习PERL
没明白,你指的数组相同是啥?
以
SNP_A-4194556 AB 0.01 ...
yinyuemi 发表于 2011-07-06 08:54
没明白,你指的数组相同是啥?
以
SNP_A-4194556 AB 0.01 ...
yinyuemi 发表于 2011-07-06 08:54
是说的是AB,就单单是AB,BB,AB,AA这样的数组。。。。
作者: 努力学习PERL 发布时间: 2011-07-06
回复 努力学习PERL
笨办法:
复制代码
笨办法:
- echo 'SNP_A-4194556 AB 0.016 BB 0.026 AB 0.036 AA 0.115 rs12058711
- SNP_A-4200262 BB 0.045 BB 0.109 BB 0.093 AA 0.243 rs11205411
- SNP_A-2244055 BB 0.049 AB 0.012 BB 0.023 BB 0.049 rs11205401
- SNP_A-2105213 AB 0.006 AB 0.092 AA 0.001 AB 0.037 rs12748771 '|\
- perl -alne '{print $_ if($F[1]=~$F[3]&&$F[3]=~$F[5]&&$F[5]!~$F[7])}'
- SNP_A-4200262 BB 0.045 BB 0.109 BB 0.093 AA 0.243 rs11205411
作者: yinyuemi 发布时间: 2011-07-06
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