文件合并的问题
时间：2011-04-28
来源：互联网
两个文件，其中有相同的序列，也有不同的序列，现在想把它合并为一个文件，但是不能有重复的序列，请问应该怎样操作，我用了cat file1 file2 |sort|uniq >file3，但是不是想要的结果
file1
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
>1541271
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
file2
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
用了那个命令之后的结果是
>1541270
>1541271
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
请高手指教！
需要的结果是
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
>1541271
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
file1
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
>1541271
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
file2
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
用了那个命令之后的结果是
>1541270
>1541271
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
请高手指教！
需要的结果是
>1541270
ATGAAGATGGCGTCGAGTGACGCCAACCCA
>1541271
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
>2615996
ATGAAGATGGCGTCGAATGACGCCAACCCA
作者: 超级细菌 发布时间: 2011-04-28
回复 超级细菌
awk -vRS='(\n)?>' '++a[$0]==1'
awk -vRS='(\n)?>' '++a[$0]==1'
作者: yinyuemi 发布时间: 2011-04-28
回复 yinyuemi
请问这是什么意思啊？咋用啊？谢谢
请问这是什么意思啊？咋用啊？谢谢
作者: 超级细菌 发布时间: 2011-04-28
回复 超级细菌
复制代码
- perl -lane 'if(/>/){$a=$_}else{ if(++$b{"$a\n$_"}==1) {print "$a\n$_"};$a=""}' file1 file2
作者: yinyuemi 发布时间: 2011-04-28
感谢，好用
作者: 超级细菌 发布时间: 2011-04-28
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