问个问题
时间:2011-03-24
来源:互联网
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GTGAATGAAGATGGCGTCTAACGACGCTTCCGCTGCCGCTGTTGCCAACAGCAACAACGA
CACCGCAAAATCTTCAAGTGACGGAGTGCTTTCCAGCATGGCTGTCACTTTTAAACGAGC
CCTCGGGGCGCGGCCTAAACAGCCTCTCCCGAGGGAAATACCGCAAAGACCCCCACGGCC
.......................
对于这样的一个含有序列的文件,我想要提取出序列的一段,比方说30-100这个区域,应该用什么命令啊?
我找了一下perl的函数,也没发现哪一个适合我,请高手指教,只给我说一下思路和命令就行,不需要全部代码,谢谢!
GTGAATGAAGATGGCGTCTAACGACGCTTCCGCTGCCGCTGTTGCCAACAGCAACAACGA
CACCGCAAAATCTTCAAGTGACGGAGTGCTTTCCAGCATGGCTGTCACTTTTAAACGAGC
CCTCGGGGCGCGGCCTAAACAGCCTCTCCCGAGGGAAATACCGCAAAGACCCCCACGGCC
.......................
对于这样的一个含有序列的文件,我想要提取出序列的一段,比方说30-100这个区域,应该用什么命令啊?
我找了一下perl的函数,也没发现哪一个适合我,请高手指教,只给我说一下思路和命令就行,不需要全部代码,谢谢!
作者: 超级细菌 发布时间: 2011-03-24
substr
作者: zhlong8 发布时间: 2011-03-24
use Bio::Seq;
$sseq = $seq->subseq(30,100);
$sseq = $seq->subseq(30,100);
作者: longbow0 发布时间: 2011-03-24
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