求助：如何用perl来连接字符串
时间：2011-03-30
来源：互联网
我有306个文件，每个文件里面的内容类似于：
复制代码
复制代码
复制代码
我想达到这样的目的，将seq相同的序列合在一起，如：将>seqAn1,>seqAn2…>seqAn306下面的那些字符序列按顺序合在一起;
- #文件1:
- >seqAn1
- actgagcatgacagtagac
- agcatag
- >seqBn1
- actagacagatcagagatc
- acagat
- >seqCn1
- acagtagacgatgacagtc
- acatcg
- …
- #文件2:
- >seqAn2
- acagatgacagatagacagat
- acagatca
- >seqBn2
- acagatgacagatacacagat
- acacgatagacacagatagga
- cacgt
- >seqCn2
- acagatgacacagatgacaca
- acagatgacaacacagatgaa
- caccagagag--agcaagta
- …
- #文件306:
- >seqAn306
- acagatgacacagatgacagatagaca
- acagatgacagatagacagtagacagt
- acaagatgac
- >seqBn306
- acagatgacacagatgacacagatgac
- acagatgacacagtta
- >seqCn306
- acagatgaca---cagatgaca-acaga
- acacag
- …
作者: xp198766 发布时间: 2011-03-30
利用 HASH了
作者: liyangole 发布时间: 2011-03-30
my ($title,%seq,@array);
while (<FH>) {
chomp;
if (/^>/) {
$title = $_;
print
}
else {
$seq{$title} .= $_;
print
}
}
while (<FH>) {
chomp;
if (/^>/) {
$title = $_;
}
else {
$seq{$title} .= $_;
}
}
作者: leigh111 发布时间: 2011-03-30
回复 liyangole
我是新手，也想到用hash，感觉不知道从哪里下手
我是新手，也想到用hash，感觉不知道从哪里下手
作者: xp198766 发布时间: 2011-03-30
回复 xp198766
请问，我的文件非常多，怎么都输入perl里面呢？一个一个点吗？
请问，我的文件非常多，怎么都输入perl里面呢？一个一个点吗？
作者: xp198766 发布时间: 2011-03-30
为什么这么多搞基因的连门都没入就开始做事…… 作者: zhlong8 发布时间: 2011-03-30
回复 zhlong8
生物出身，想学习来着，非常初级的还行，稍微复杂点的就完不成了……还请各位包涵……
生物出身，想学习来着，非常初级的还行，稍微复杂点的就完不成了……还请各位包涵……
作者: xp198766 发布时间: 2011-03-30
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