怎么按某一列分类,把文件拆分,写入不同的文件???
时间:2011-01-04
来源:互联网
本帖最后由 nb509 于 2011-01-04 00:18 编辑
文件格式:
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我要按照第8列,把文件拆分,分别写入不同的文件里。文件名为:ch1.txt、ch2.txt、ch3.txt。。。。
我用下面代码,10万行数据,用了3分钟多。
复制代码
如果直接读取,写入一个文件,1秒不到。
复制代码
怎么优化啊?????
文件格式:
- 0 1 2 3 4 5 6 ch1
- 0 1 4 3 4 5 6 ch3
- 0 1 2 3 4 5 6 ch2
- 0 1 3 3 4 5 6 ch1
- 0 1 6 3 4 5 6 ch1
- 0 1 1 3 4 5 6 ch1
- 0 1 2 3 4 5 6 ch2
- 0 1 2 3 4 5 6 ch2
- 0 1 2 3 4 5 6 ch4
- 0 1 2 3 4 5 6 ch3
- 0 1 2 3 4 5 6 ch1
- 0 1 2 3 4 5 6 ch1
我用下面代码,10万行数据,用了3分钟多。
- open (FILE,"<$in") or die"$!";
- while (<FILE>)
- {
- split;
- open (OUT,">>@_[7].txt") or die"$!"; #这里操作频繁,太慢了吧!!
-
- print OUT $_;
- }
- }
- open (FILE,"<$in") or die"$!";
- open (OUT,">>ch.txt") or die"$!";
- while (<FILE>)
- {
- split;
-
- print OUT $_;
- }
- }
作者: nb509 发布时间: 2011-01-04
这个就是按照染色体名称merge数据么 你可以按照染色体号先打来 对应数量的句柄 然后在辨别写入 还有识别染色体号别用split 用正则匹配 就是最后一个单词么 把染色体号抓出来
作者: ssuuzzhhee 发布时间: 2011-01-04
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