求教怎样合并行

我想把下列文件:
>se1
aaaaaaaaaaaaa
bbbbbbbbbbbbb
ccccccccccccccccc
>se2
ccccccccccccccccc
bbbbbbbbbbbbb
aaaaaaaaaaaaa
>se3
bbbbbbbbbbbbb
ccccccccccccccccc
aaaaaaaaaaaaa

处理成下面这样:
>se1
aaaaaaaaaaaabbbbbbbbbbbbcccccccccc
>se2
ccccccccccccccccbbbbbbbbbbbaaaaaaaaa
>se3
bbbbbbbbbbbbccccccccccccccaaaaaaaaa
有什么好办法来处理,请求帮助一下新手.

[oracle@imeg02 zgw]$ perl -pe 's/\n//g;s/\>se\d+/\n$&\n/g;' file

>se1
aaaaaaaaaaaaabbbbbbbbbbbbbccccccccccccccccc
>se2
cccccccccccccccccbbbbbbbbbbbbbaaaaaaaaaaaaa
>se3
bbbbbbbbbbbbbcccccccccccccccccaaaaaaaaaaaaa

凑合用吧