freebsd中毒或是被黑后重装系统怎么样不影响原来的数据？

比如说，系统是中毒了， 或是被黑了，
又查不出原因， 时间紧迫，不得不重装系统
但是又因为服务器上有不少数据， 比如home下的ftp文件夹，

我自己遇到过， 我朋友也遇到过这样的问题，
处理的方法都是拿一个新硬盘过去把ftp文件夹拷走， 然后重做系统，

这样很麻烦，并且如果ftp文件夹大的话， 比如说1000G
处理起来不只是速度上的问题

请问，

有没有办法在不影响原来的数据的情况下重装系统

或是从第一次装系统的时候就注意这个问题
比如我第一次装系统，
我正常分区，并且多增加一个webftp的分驱
然后把数据放这里面， 如果以后系统有了问题，我把除了webftp的分区都删除， 然后重新分区， 重新安装，这样行不行？？能不能保住webftp里面的数据？？？

这些数据放到
/
/usr
/var
/tmp
以外的分区
重装后再mount

数据放在独立的分区,重装时只格式化系统分区就行啦.